17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3406 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3406  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3454  hypothetical protein  69.73 
 
 
191 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4784  hypothetical protein  42.13 
 
 
220 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10791  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2422  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393774  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0977  hypothetical protein  52.85 
 
 
156 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000975488 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5366  hypothetical protein  33.06 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0864934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0438  hypothetical protein  32.55 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6155  hypothetical protein  40.58 
 
 
222 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384528  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0403  hypothetical protein  27.73 
 
 
220 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2240  hypothetical protein  29.39 
 
 
288 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151082  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5746  hypothetical protein  28.76 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184915  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0389  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0383  hypothetical protein  24.88 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6769  hypothetical protein  26.79 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34607  normal  0.0573605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1394  hypothetical protein  27.52 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2552  hypothetical protein  33.63 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00146174  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4316  hypothetical protein  28.12 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0666446  hitchhiker  0.00872986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>