15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6155 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6155  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0438  hypothetical protein  52.71 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4784  hypothetical protein  35.81 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10791  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2422  hypothetical protein  35.65 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393774  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3454  hypothetical protein  35.64 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3406  hypothetical protein  40.58 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0864934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0403  hypothetical protein  22.46 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489311  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5746  hypothetical protein  30.89 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2240  hypothetical protein  27.1 
 
 		 288 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151082  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0389  hypothetical protein  22.84 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6156  hypothetical protein  52.63 
 
 		 54 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6769  hypothetical protein  24.86 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34607  normal  0.0573605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0383  hypothetical protein  23.47 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0977  hypothetical protein  30.59 
 
 		 156 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000975488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>