14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2422 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2422  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393774  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4784  hypothetical protein  95.45 
 
 
220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10791  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3454  hypothetical protein  45.26 
 
 
191 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3406  hypothetical protein  41.67 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6155  hypothetical protein  35.65 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0438  hypothetical protein  37.09 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5366  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0864934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0403  hypothetical protein  29.68 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489311  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6769  hypothetical protein  33.72 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34607  normal  0.0573605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0389  hypothetical protein  27.93 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0383  hypothetical protein  26.13 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2240  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151082  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5746  hypothetical protein  28.26 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184915  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0977  hypothetical protein  29.6 
 
 
156 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000975488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>