15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3454 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3454  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3406  hypothetical protein  69.73 
 
 
222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2422  hypothetical protein  45.26 
 
 
232 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0393774  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4784  hypothetical protein  44.74 
 
 
220 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10791  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0403  hypothetical protein  35.52 
 
 
220 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0977  hypothetical protein  60.64 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000975488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6155  hypothetical protein  35.64 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0438  hypothetical protein  36.21 
 
 
210 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5366  hypothetical protein  34.69 
 
 
249 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0864934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0389  hypothetical protein  27.47 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0383  hypothetical protein  27.53 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6769  hypothetical protein  32.8 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34607  normal  0.0573605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2240  hypothetical protein  37.69 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151082  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5746  hypothetical protein  36.76 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184915  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1394  hypothetical protein  27.08 
 
 
279 aa  55.1  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>