More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0415 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3044  magnesium-translocating P-type ATPase  79.93 
 
 		 899 aa  1450    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04110  magnesium transporter  53.41 
 
 		 898 aa  942    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3752  magnesium-translocating P-type ATPase  53.41 
 
 		 898 aa  942    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2645  magnesium-translocating P-type ATPase  68.4 
 
 		 920 aa  1273    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1929  magnesium-translocating P-type ATPase  50.81 
 
 		 951 aa  877    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4041  magnesium-translocating P-type ATPase  72.02 
 
 		 908 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884225  normal  0.268876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1451  P-type ATPase, Mg2+ ATPase transport protein  51.17 
 
 		 890 aa  829    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.05672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4554  magnesium-translocating P-type ATPase  50.12 
 
 		 875 aa  844    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0120599  normal  0.0617915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4212  magnesium-translocating P-type ATPase  55.62 
 
 		 901 aa  1044    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2136  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.62 
 
 		 919 aa  927    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2830  magnesium ABC transporter ATPase  77.6 
 
 		 899 aa  1395    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.574318  normal  0.199636 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0037  magnesium ion-transporting ATPase E1-E2 family protein  68.9 
 
 		 905 aa  1250    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2327  magnesium-translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 847 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1703  magnesium-translocating P-type ATPase  68.22 
 
 		 898 aa  1240    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0225  magnesium-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 861 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1194  magnesium-translocating P-type ATPase  40.79 
 
 		 971 aa  700    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5740  magnesium-translocating P-type ATPase  60.87 
 
 		 921 aa  1097    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14161  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0707  magnesium-translocating P-type ATPase  55.05 
 
 		 878 aa  1009    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00140907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0437  magnesium-translocating P-type ATPase  47.47 
 
 		 880 aa  795    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118486 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1250  magnesium-translocating P-type ATPase  60.44 
 
 		 900 aa  1095    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4814  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.41 
 
 		 898 aa  944    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3981  magnesium-translocating P-type ATPase  55.47 
 
 		 901 aa  1031    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2078  ATPase, E1-E2 type:magnesium-translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 852 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1097  magnesium-translocating P-type ATPase  49.16 
 
 		 890 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1214  ATPase, E1-E2 type:magnesium-translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 899 aa  769    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.135802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1341  magnesium-translocating P-type ATPase  60.99 
 
 		 928 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1633  magnesium-translocating P-type ATPase  77.78 
 
 		 899 aa  1400    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2901  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.48 
 
 		 903 aa  937    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.627065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1904  magnesium-translocating P-type ATPase  51.96 
 
 		 912 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000904322  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2583  magnesium-translocating P-type ATPase  60.99 
 
 		 928 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4079  magnesium-translocating P-type ATPase  62.07 
 
 		 920 aa  1116    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5764  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.41 
 
 		 898 aa  942    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1423  magnesium-translocating P-type ATPase  60.56 
 
 		 928 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1860  magnesium-transporting ATPase MgtA  55.13 
 
 		 899 aa  963    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0493  magnesium-translocating P-type ATPase  95.46 
 
 		 903 aa  1781    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0033  magnesium-translocating P-type ATPase  68.67 
 
 		 905 aa  1244    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1059  magnesium-translocating P-type ATPase  49.12 
 
 		 896 aa  904    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.380311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1281  magnesium-translocating P-type ATPase  61.7 
 
 		 921 aa  1110    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4457  magnesium-translocating P-type ATPase  61.38 
 
 		 923 aa  1109    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4723  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.1 
 
 		 898 aa  942    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.727416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0981  magnesium-translocating P-type ATPase  56.46 
 
 		 901 aa  1040    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4497  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.41 
 
 		 898 aa  943    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4841  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.41 
 
 		 898 aa  942    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3988  magnesium-translocating P-type ATPase  72.02 
 
 		 908 aa  1327    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4254  magnesium-translocating P-type ATPase  55.53 
 
 		 901 aa  1033    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000928518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3515  magnesium-transporting ATPase MgtA  54.28 
 
 		 930 aa  960    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4092  magnesium-translocating P-type ATPase  72.02 
 
 		 908 aa  1327    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0087  magnesium-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 942 aa  667    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4838  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.47 
 
 		 926 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04074  hypothetical protein  53.41 
 
 		 898 aa  942    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1418  magnesium-translocating P-type ATPase  60.93 
 
 		 929 aa  1108    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3919  magnesium-translocating P-type ATPase  53.48 
 
 		 910 aa  930    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0543  magnesium-translocating P-type ATPase  50.11 
 
 		 920 aa  911    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1285  magnesium-translocating P-type ATPase  43.38 
 
 		 864 aa  691    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000219162  decreased coverage  0.00727279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0493  magnesium-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 828 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1076  magnesium-translocating P-type ATPase  60.44 
 
 		 928 aa  1094    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf111  cation-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 		 911 aa  733    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5544  magnesium ABC transporter ATPase  73.03 
 
 		 903 aa  1345    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2642  magnesium-translocating P-type ATPase  50.73 
 
 		 892 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4804  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.47 
 
 		 918 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.306694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0535  magnesium-transporting ATPase MgtA  52.49 
 
 		 902 aa  944    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2569  magnesium-translocating P-type ATPase  49.22 
 
 		 908 aa  888    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0850048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2150  magnesium-translocating P-type ATPase  69.28 
 
 		 904 aa  1270    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0398  magnesium-transporting ATPase MgtA  51.49 
 
 		 920 aa  932    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398954  normal  0.0934154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0415  magnesium-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 903 aa  1862    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54394  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3803  magnesium-translocating P-type ATPase  60.87 
 
 		 921 aa  1097    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3092  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.72 
 
 		 903 aa  928    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1229  magnesium-transporting ATPase MgtA  52.71 
 
 		 919 aa  936    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1744  magnesium-translocating P-type ATPase  77.72 
 
 		 899 aa  1398    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1153  magnesium-translocating P-type ATPase  51.13 
 
 		 889 aa  927    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4709  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.47 
 
 		 926 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0635  magnesium-translocating P-type ATPase  53.15 
 
 		 895 aa  964    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230455  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0223  magnesium-translocating P-type ATPase  60.44 
 
 		 928 aa  1094    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0441  magnesium-transporting ATPase MgtA  52.71 
 
 		 902 aa  942    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3969  magnesium-translocating P-type ATPase  72.02 
 
 		 908 aa  1327    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4421  magnesium-translocating P-type ATPase  50.12 
 
 		 875 aa  844    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1965  magnesium-translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 847 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3993  magnesium-translocating P-type ATPase  61.02 
 
 		 926 aa  1107    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4565  magnesium-translocating P-type ATPase  60.87 
 
 		 921 aa  1097    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63800  Mg(2+) transport ATPase, P-type 2  72.7 
 
 		 903 aa  1342    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0549112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1370  cation-transporting P-ATPase  47.83 
 
 		 910 aa  844    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4155  magnesium-translocating P-type ATPase  71.91 
 
 		 908 aa  1326    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3769  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.41 
 
 		 898 aa  943    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.750122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0495  magnesium-translocating P-type ATPase  60.44 
 
 		 928 aa  1094    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0962  cation transport ATPase  43.16 
 
 		 912 aa  733    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4859  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.47 
 
 		 918 aa  930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.799705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3183  magnesium-translocating P-type ATPase  69.09 
 
 		 904 aa  1265    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4740  magnesium-transporting ATPase MgtA  53.47 
 
 		 902 aa  930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0930  magnesium-translocating P-type ATPase  37.99 
 
 		 846 aa  599  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0611  magnesium-translocating P-type ATPase  40.92 
 
 		 868 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl496  Mg2+ transport ATPase  37.51 
 
 		 886 aa  587  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3478  magnesium-translocating P-type ATPase  38.22 
 
 		 887 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2564  magnesium-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 826 aa  553  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2973  magnesium-translocating P-type ATPase  39.33 
 
 		 843 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45466  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1388  magnesium-translocating P-type ATPase  38.25 
 
 		 864 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2103  magnesium transport P-type atpase  36.56 
 
 		 842 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.617002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0795  magnesium-translocating P-type ATPase  35.28 
 
 		 810 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4812  Mg(2+) transport ATPase, P-type  39.98 
 
 		 893 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  36.58 
 
 		 1195 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2615  magnesium-translocating P-type ATPase  39.23 
 
 		 894 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0422501  normal  0.109968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>