More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0455  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  96.88 
 
 
577 aa  1065    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03460  Gamma-glutamyltranspeptidase precursor  68.16 
 
 
567 aa  661    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4193  gamma-glutamyltransferase  68.5 
 
 
552 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04730  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  100 
 
 
577 aa  1152    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  53.66 
 
 
596 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2654  gamma-glutamyltransferase 1  52.14 
 
 
553 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0302654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  52.08 
 
 
576 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0093  gamma-glutamyltransferase  52.13 
 
 
567 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0769  gamma-glutamyltransferase  52.17 
 
 
557 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.303985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0610  hypothetical protein  48.31 
 
 
574 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0591  hypothetical protein  48.31 
 
 
574 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00307  gamma-glutamyltransferase  47.96 
 
 
597 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0271  gamma-glutamyltransferase  45.1 
 
 
603 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.752949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0301  gamma-glutamyltransferase  45.1 
 
 
603 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1553  gamma-glutamyltransferase  46.3 
 
 
576 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  44.06 
 
 
574 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  41.04 
 
 
587 aa  340  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  40.16 
 
 
575 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  41.46 
 
 
587 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  41.39 
 
 
578 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  39.17 
 
 
575 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  40.9 
 
 
575 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  41.08 
 
 
576 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  41.08 
 
 
576 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  41.43 
 
 
579 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 
583 aa  332  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 
578 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  41.45 
 
 
588 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  39.59 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  37.78 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  37.81 
 
 
599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 
599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
583 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
583 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
583 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 
583 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  37.16 
 
 
583 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 
617 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  40.11 
 
 
581 aa  324  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  39.12 
 
 
592 aa  324  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  39.72 
 
 
587 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  39.12 
 
 
597 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
576 aa  323  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  39.84 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 
587 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  40.44 
 
 
587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
579 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
579 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
579 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  37.24 
 
 
579 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 
606 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  38.37 
 
 
583 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  41.49 
 
 
594 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  37.99 
 
 
579 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  39.79 
 
 
594 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  40.44 
 
 
577 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  36.76 
 
 
560 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  37.62 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  37.62 
 
 
579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 
588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  38.8 
 
 
579 aa  313  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  37.65 
 
 
579 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 
586 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  38.33 
 
 
590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  40.8 
 
 
589 aa  309  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  38.46 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  37.24 
 
 
583 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  40.67 
 
 
586 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  38.06 
 
 
581 aa  306  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  36.05 
 
 
556 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  38.38 
 
 
557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 
555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  38.11 
 
 
587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.3 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  40.95 
 
 
584 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 
555 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  42.54 
 
 
589 aa  303  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  40.63 
 
 
581 aa  303  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.34 
 
 
645 aa  303  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  38.86 
 
 
602 aa  302  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 
617 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  36.96 
 
 
645 aa  302  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 
556 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  36.64 
 
 
619 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  37.86 
 
 
576 aa  301  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 
580 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  41.6 
 
 
583 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  39.31 
 
 
606 aa  300  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  36.65 
 
 
604 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  38.4 
 
 
571 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  37.3 
 
 
576 aa  299  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
596 aa  299  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  37.75 
 
 
593 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  41.54 
 
 
586 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>