27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_02371  exodeoxyribonuclease small subunit  100 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0366  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.61 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2325  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.34 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01061  exodeoxyribonuclease VII  43.18 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1461  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01631  exodeoxyribonuclease VII  40.68 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.158288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3371  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.58 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2633  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.77 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.35 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  32.84 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.65 
 
 		 81 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.31 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.88 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.65 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>