15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27973 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_27973  predicted protein  100 
 
 
314 aa  634    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3321  ATPase  28.29 
 
 
935 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  27.14 
 
 
852 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  23.92 
 
 
898 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  25.73 
 
 
885 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  25.73 
 
 
891 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  25.73 
 
 
885 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  23.85 
 
 
863 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_002620  TC0389  ATP-dependent Clp protease, subunit B  22.45 
 
 
867 aa  43.9  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  24.87 
 
 
441 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06361  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  22.55 
 
 
863 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344942  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1760  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  24.9 
 
 
769 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0476862  normal  0.109361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  24.9 
 
 
863 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  26.15 
 
 
854 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  25 
 
 
830 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>