19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1145 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  37.66 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.04 
 
 		 816 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0329  glutaredoxin  34.67 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.923788  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0153  glutaredoxin-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.369669  normal  0.0212592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2234  thioredoxin:glutaredoxin  27.5 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  31.58 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  32 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  30.26 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  30.26 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1173  glutaredoxin-like domain protein  25.81 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2843  glutaredoxin  34.21 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.486982  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2727  dehydrogenase, selenocysteine-containing protein  27.62 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.305713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  32.94 
 
 		 555 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  29.21 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4420  thioredoxin/glutaredoxin  25.97 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0845291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3642  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  35.53 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  28.57 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>