10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4420 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4420  thioredoxin/glutaredoxin  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0845291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2234  thioredoxin:glutaredoxin  45.12 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  37.14 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  37.18 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  30.38 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  34.18 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  35.71 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  25.97 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  27.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0262  glutaredoxin  33.33 
 
 		 259 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000677052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>