11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0262 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0262  glutaredoxin  100 
 
 
259 aa  530  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000677052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1866  thioredoxin/glutaredoxin-like protein  39.61 
 
 
258 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.428974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1289  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0058  thioredoxin/glutaredoxin-like  27.95 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0524  hypothetical protein  24.52 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0749917 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1796  hypothetical protein  22.57 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.100728 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1671  hypothetical protein  23.13 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1607  hypothetical protein  23.48 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0639  hypothetical protein  32.86 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  26.09 
 
 
529 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1101  NADH dehydrogenase  27.63 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>