10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2234 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2234  thioredoxin:glutaredoxin  100 
 
 
86 aa  173  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4420  thioredoxin/glutaredoxin  45.12 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0845291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  34.18 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  34.18 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  34.18 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  31.65 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  30.38 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  27.5 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0262  glutaredoxin  35.29 
 
 
259 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000677052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2778  redox-active disulfide protein 2  35 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>