25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0076 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0076  RNA-binding protein Nop10p  100 
 
 		 51 aa  107  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.592689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1151  RNA-binding protein Nop10p  51.11 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.871506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0415  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  48.94 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1688  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.240785  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0432  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1566  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  53.33 
 
 		 51 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1782  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0996  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0965  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  48.89 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.496122  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2024  RNA-binding protein Nop10p  45.65 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0958  RNA-binding protein Nop10p  51.11 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.351379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1700  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  46.67 
 
 		 51 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1397  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  51.11 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0139355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0981  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  46.67 
 
 		 51 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1856  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  48.89 
 
 		 53 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.875885 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1008  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  51.16 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1939  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  55.56 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000133233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1127  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  46.67 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2603  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  44.9 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1360  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  48.84 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.151364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1801  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  48.89 
 
 		 53 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08254  ribosome biogenesis protein Nop10 (Broad)  60 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1347  normal  0.683847 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0704  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  46.51 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2561  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  44.44 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.510114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2881  RNA-binding protein Nop10p  40 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.488424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>