18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1360 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1360  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  100 
 
 		 76 aa  158  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.151364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0432  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.86 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1688  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  51.43 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.240785  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0996  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.11 
 
 		 78 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1782  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.14 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1939  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.62 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000133233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0415  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  46.43 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1566  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.17 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1151  RNA-binding protein Nop10p  46 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.871506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0076  RNA-binding protein Nop10p  48.84 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.592689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1801  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  44.68 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1008  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  48.98 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1397  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  50 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0139355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0981  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 51 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0965  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.92 
 
 		 51 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.496122  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1700  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.92 
 
 		 51 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2024  RNA-binding protein Nop10p  42.86 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0704  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  43.14 
 
 		 51 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>