27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2603 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2603  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  100 
 
 		 55 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0958  RNA-binding protein Nop10p  65.31 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.351379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1127  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  61.22 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1856  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  56.86 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.875885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2561  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  60 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.510114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1151  RNA-binding protein Nop10p  57.14 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.871506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2024  RNA-binding protein Nop10p  46.94 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0415  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  58.7 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1801  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  57.78 
 
 		 53 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1566  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  51.02 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1939  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.17 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000133233  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1782  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  56.52 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1700  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.83 
 
 		 51 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1397  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  48.98 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0139355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0981  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.83 
 
 		 51 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0965  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  43.48 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.496122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0076  RNA-binding protein Nop10p  44.9 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.592689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2791  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.73 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2503  RNA-binding protein Nop10p  52.73 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.420241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0704  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  43.48 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1008  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  41.3 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0432  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1688  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.240785  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0996  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1008  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0869  RNA-binding protein Nop10p  50 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31537  predicted protein  48.72 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0162127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>