12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4482 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0219075  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0278  hypothetical protein  83.59 
 
 		 196 aa  338  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4982  hypothetical protein  80.93 
 
 		 195 aa  329  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4664  hypothetical protein  77.6 
 
 		 196 aa  313  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654345  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8098  hypothetical protein  75.77 
 
 		 199 aa  308  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4321  hypothetical protein  74.87 
 
 		 313 aa  307  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9171  hypothetical protein  75 
 
 		 199 aa  301  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4755  hypothetical protein  74.74 
 
 		 199 aa  296  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7038  hypothetical protein  74.86 
 
 		 281 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9558  hypothetical protein  72.43 
 
 		 195 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422586  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3720  hypothetical protein  42.7 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.199556  normal  0.0832499 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  27.87 
 
 		 310 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>