11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4982 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4982  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4664  hypothetical protein  82.38 
 
 
196 aa  330  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654345  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4482  hypothetical protein  80.93 
 
 
195 aa  329  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0219075  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4321  hypothetical protein  80.32 
 
 
313 aa  320  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0278  hypothetical protein  79.38 
 
 
196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9171  hypothetical protein  75.38 
 
 
199 aa  307  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4755  hypothetical protein  79.35 
 
 
199 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9558  hypothetical protein  78.97 
 
 
195 aa  301  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422586  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8098  hypothetical protein  75.13 
 
 
199 aa  300  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7038  hypothetical protein  70.27 
 
 
281 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3720  hypothetical protein  43.5 
 
 
199 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.199556  normal  0.0832499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>