11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9171 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9171  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8098  hypothetical protein  87.37 
 
 		 199 aa  353  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4755  hypothetical protein  85.71 
 
 		 199 aa  339  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9558  hypothetical protein  83.42 
 
 		 195 aa  328  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422586  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4664  hypothetical protein  78.17 
 
 		 196 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654345  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4982  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0278  hypothetical protein  75.13 
 
 		 196 aa  304  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4482  hypothetical protein  75 
 
 		 195 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0219075  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4321  hypothetical protein  73.91 
 
 		 313 aa  285  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7038  hypothetical protein  64.92 
 
 		 281 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3720  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.199556  normal  0.0832499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>