11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9558 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9558  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422586  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9171  hypothetical protein  83.42 
 
 		 199 aa  340  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8098  hypothetical protein  83.84 
 
 		 199 aa  335  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4755  hypothetical protein  87.3 
 
 		 199 aa  331  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4664  hypothetical protein  78.24 
 
 		 196 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654345  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4982  hypothetical protein  78.97 
 
 		 195 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0278  hypothetical protein  75.26 
 
 		 196 aa  301  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4482  hypothetical protein  72.68 
 
 		 195 aa  298  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0219075  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4321  hypothetical protein  75 
 
 		 313 aa  289  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7038  hypothetical protein  68.78 
 
 		 281 aa  272  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3720  hypothetical protein  41.24 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.199556  normal  0.0832499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>