More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4377 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2384  magnesium-translocating P-type ATPase  73.39 
 
 
839 aa  1094    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28928  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2203  magnesium-translocating P-type ATPase  69.85 
 
 
849 aa  1054    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0549009  normal  0.847687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6096  magnesium-translocating P-type ATPase  70.98 
 
 
874 aa  956    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0117482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2078  ATPase, E1-E2 type:magnesium-translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
852 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1965  magnesium-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
847 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2327  magnesium-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
847 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2604  magnesium-translocating P-type ATPase  72.54 
 
 
867 aa  1087    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181864  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0493  magnesium-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
828 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1846  putative magnesium-translocating P-type ATPase  74.32 
 
 
854 aa  1121    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4377  magnesium-translocating P-type ATPase  100 
 
 
812 aa  1596    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2973  magnesium-translocating P-type ATPase  51.85 
 
 
843 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45466  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8078  magnesium-translocating P-type ATPase  72.06 
 
 
859 aa  1023    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0415  magnesium-translocating P-type ATPase  73.15 
 
 
862 aa  1094    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0631  magnesium-translocating P-type ATPase  81.4 
 
 
858 aa  1228    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409456  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0611  magnesium-translocating P-type ATPase  47.26 
 
 
868 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0225  magnesium-translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
861 aa  618  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1285  magnesium-translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
864 aa  599  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000219162  decreased coverage  0.00727279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1388  magnesium-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
864 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0930  magnesium-translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
846 aa  568  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1904  magnesium-translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
912 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000904322  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0535  magnesium-transporting ATPase MgtA  39.52 
 
 
902 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2901  magnesium-transporting ATPase MgtA  39.49 
 
 
903 aa  552  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.627065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04110  magnesium transporter  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3752  magnesium-translocating P-type ATPase  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5764  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2564  magnesium-translocating P-type ATPase  41.45 
 
 
826 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1451  P-type ATPase, Mg2+ ATPase transport protein  39.93 
 
 
890 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.05672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4814  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4841  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4723  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.727416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04074  hypothetical protein  37.91 
 
 
898 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4497  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3769  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.91 
 
 
898 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.750122  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2642  magnesium-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
892 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3092  magnesium-transporting ATPase MgtA  39.25 
 
 
903 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4421  magnesium-translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
875 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4554  magnesium-translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
875 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0120599  normal  0.0617915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0441  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.79 
 
 
902 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3515  magnesium-transporting ATPase MgtA  38.27 
 
 
930 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1929  magnesium-translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
951 aa  535  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0707  magnesium-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
878 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00140907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2103  magnesium transport P-type atpase  38.46 
 
 
842 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.617002  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1860  magnesium-transporting ATPase MgtA  38.43 
 
 
899 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1153  magnesium-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
889 aa  532  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  41.97 
 
 
1195 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1097  magnesium-translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
890 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141494  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4740  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.97 
 
 
902 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4838  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.97 
 
 
926 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4709  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.97 
 
 
926 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4804  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.85 
 
 
918 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.306694  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4859  magnesium-transporting ATPase MgtA  38.74 
 
 
918 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.799705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0635  magnesium-translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
895 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3478  magnesium-translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
887 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2136  magnesium-transporting ATPase MgtA  37.78 
 
 
919 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4812  Mg(2+) transport ATPase, P-type  41.86 
 
 
893 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2615  magnesium-translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
894 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0422501  normal  0.109968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1229  magnesium-transporting ATPase MgtA  38.28 
 
 
919 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4212  magnesium-translocating P-type ATPase  35.4 
 
 
901 aa  515  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0981  magnesium-translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
901 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3981  magnesium-translocating P-type ATPase  35.6 
 
 
901 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf111  cation-translocating P-type ATPase  34.22 
 
 
911 aa  514  1e-144  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0795  magnesium-translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
810 aa  511  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4254  magnesium-translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
901 aa  512  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000928518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3919  magnesium-translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
910 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0437  magnesium-translocating P-type ATPase  38.84 
 
 
880 aa  512  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3044  magnesium-translocating P-type ATPase  37.47 
 
 
899 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1214  ATPase, E1-E2 type:magnesium-translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
899 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.135802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3183  magnesium-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
904 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2645  magnesium-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
920 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0037  magnesium ion-transporting ATPase E1-E2 family protein  37.19 
 
 
905 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1281  magnesium-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
921 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30845  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0543  magnesium-translocating P-type ATPase  34.79 
 
 
920 aa  506  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2150  magnesium-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
904 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0398  magnesium-transporting ATPase MgtA  36.72 
 
 
920 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398954  normal  0.0934154 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0033  magnesium-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
905 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1633  magnesium-translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
899 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2830  magnesium ABC transporter ATPase  37.4 
 
 
899 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.574318  normal  0.199636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3988  magnesium-translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
908 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2583  magnesium-translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
928 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4155  magnesium-translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
908 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1703  magnesium-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
898 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1744  magnesium-translocating P-type ATPase  37.51 
 
 
899 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1341  magnesium-translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
928 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4457  magnesium-translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
923 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3969  magnesium-translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
908 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4041  magnesium-translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
908 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884225  normal  0.268876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1250  magnesium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
900 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0415  magnesium-translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
903 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54394  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1423  magnesium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
928 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1059  magnesium-translocating P-type ATPase  34.73 
 
 
896 aa  495  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.380311  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0223  magnesium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
928 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1076  magnesium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
928 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0495  magnesium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
928 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1370  cation-transporting P-ATPase  35.67 
 
 
910 aa  495  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4092  magnesium-translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
908 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3803  magnesium-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
921 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3993  magnesium-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
926 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5740  magnesium-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
921 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14161  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0493  magnesium-translocating P-type ATPase  36.3 
 
 
903 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4565  magnesium-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
921 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>