12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2642 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1389    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2625  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.13 
 
 		 518 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3478  hypothetical protein  28.97 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0491263  normal  0.0992752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0290  hypothetical protein  25.94 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2749  hypothetical protein  26.39 
 
 		 654 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0827  hypothetical protein  26.78 
 
 		 645 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3528  hypothetical protein  24.93 
 
 		 633 aa  154  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00681289  decreased coverage  0.00698829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5261  Valyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 672 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3721  hypothetical protein  24.55 
 
 		 727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4290  hypothetical protein  22.92 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1019  hypothetical protein  23.4 
 
 		 881 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0317  hypothetical protein  24.59 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.549101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>