26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2268 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1995  hypothetical protein  84.09 
 
 		 88 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.382261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4706  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0626752  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2272  hypothetical protein  62.5 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355382  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2442  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  57.95 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.337036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3012  hypothetical protein  56.82 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.500219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0917  hypothetical protein  55.88 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0966  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.94 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.853477  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1420  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0626  hypothetical protein  45.83 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0629  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2653  hypothetical protein  47.3 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2849  Sel1 domain-containing protein  47.06 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0412947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1696  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000227045  decreased coverage  0.00292714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3004  Sel1  47.22 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3102  Sel1 repeat-containing protein  40.26 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1527  hypothetical protein  43.28 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.924087  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1119  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4428  Sel1 domain-containing protein  51.52 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2787  Sel1 domain-containing protein  46.97 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0664  Sel1 domain-containing protein  50.72 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 1261 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1275 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  32.26 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.87 
 
 		 565 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>