31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1866 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1866  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  100 
 
 
70 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  62.71 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  49.21 
 
 
315 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  49.21 
 
 
315 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  66.67 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  51.72 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  64.86 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  53.45 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  46.15 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  50 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  50 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  47.37 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  47.37 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.25 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.39 
 
 
314 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>