12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4661 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4661  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  500  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0472  hypothetical protein  41.44 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3108  hypothetical protein  32.36 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.589805  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3470  hypothetical protein  35.34 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0375  putative transmembrane anti-sigma factor  32.97 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.803689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3260  hypothetical protein  30.54 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4203  hypothetical protein  32.51 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0199  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.29 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  28.49 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2023  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00757255  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  31.9 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  29.62 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>