9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0199 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0199  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 266 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0472  hypothetical protein  39.85 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3470  hypothetical protein  35.47 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0375  putative transmembrane anti-sigma factor  52.25 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.803689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4203  hypothetical protein  32.52 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3108  hypothetical protein  36.71 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.589805  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3260  hypothetical protein  32.02 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4661  hypothetical protein  35.29 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2023  hypothetical protein  37.11 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00757255  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>