13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0989 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0989  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  747    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.39 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  29.44 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  30.12 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  27.14 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.59 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  29.25 
 
 
427 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  25.1 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  32.17 
 
 
373 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  25.29 
 
 
431 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  25.9 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  31.17 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  31.03 
 
 
497 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>