10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4888 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  100 
 
 		 497 aa  932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  56.8 
 
 		 427 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  42.38 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  45.64 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  30.73 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.77 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  26.21 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  32.28 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  24.18 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  30.61 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>