19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0935 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0935  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4255  hypothetical protein  46.08 
 
 
314 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607115  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5704  hypothetical protein  45.32 
 
 
273 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6821  hypothetical protein  45.29 
 
 
273 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1157  hypothetical protein  41.28 
 
 
280 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5271  hypothetical protein  43.06 
 
 
264 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1785  hypothetical protein  37.25 
 
 
275 aa  135  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3831  hypothetical protein  47.73 
 
 
223 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634656  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1742  hypothetical protein  35.82 
 
 
279 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.87586  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2439  hypothetical protein  34.19 
 
 
283 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.318153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2858  hypothetical protein  32.96 
 
 
283 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4362  hypothetical protein  34.32 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3833  hypothetical protein  30.9 
 
 
258 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1826  hypothetical protein  31.56 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0825  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
274 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2088  hypothetical protein  29.1 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.610127  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0392  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0160291  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2186  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>