19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4255 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4255  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607115  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6821  hypothetical protein  45.05 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5704  hypothetical protein  44.93 
 
 
273 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0935  hypothetical protein  45.3 
 
 
297 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5271  hypothetical protein  41.72 
 
 
264 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1157  hypothetical protein  38.04 
 
 
280 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1785  hypothetical protein  35.91 
 
 
275 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3831  hypothetical protein  45 
 
 
223 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634656  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1742  hypothetical protein  35.27 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.87586  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1826  hypothetical protein  33.57 
 
 
262 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3833  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2858  hypothetical protein  32.86 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4362  hypothetical protein  31.44 
 
 
234 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0392  hypothetical protein  32.07 
 
 
267 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0160291  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2439  hypothetical protein  31.11 
 
 
283 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.318153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2088  hypothetical protein  28.26 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.610127  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0825  GCN5-related N-acetyltransferase  25.28 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>