More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0448 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0448  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  100 
 
 
240 aa  502  1e-141  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0652  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  43.46 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0644813  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0362  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.85 
 
 
267 aa  209  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1018  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  42.75 
 
 
265 aa  193  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.373164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1178  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.21 
 
 
272 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0773  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.83 
 
 
269 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1497  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.85 
 
 
269 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1062  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.98 
 
 
282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472899  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1628  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.25 
 
 
269 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1182  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
269 aa  160  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0473  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.64 
 
 
277 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.757079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2371  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.59 
 
 
258 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.08 
 
 
254 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3854  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.16 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.46 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000211584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0378  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.85 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.72 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0621  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.08 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0911  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.59 
 
 
253 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0450611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0433  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  30.04 
 
 
269 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1575  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.11 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1526  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.6 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.23 
 
 
1295 aa  118  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3052  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.23 
 
 
1295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  30.19 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0483  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.46 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.2 
 
 
1301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1169  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  31.15 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0517  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  30.31 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1845  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  30.34 
 
 
268 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 
1295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.08 
 
 
1295 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.74 
 
 
1293 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.65 
 
 
1296 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.65 
 
 
1306 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1291 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.69 
 
 
1296 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.54 
 
 
1298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2831  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2808  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2943  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2727  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2768  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1296 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.91 
 
 
1311 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3623  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1296 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.08 
 
 
1295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0434  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.91 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0601062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1253  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 
1296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  30.18 
 
 
275 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  30.32 
 
 
275 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2067  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.18 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.43 
 
 
1295 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2771  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.68 
 
 
1295 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.15 
 
 
1309 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3769  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  32.95 
 
 
256 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1082  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.06 
 
 
1295 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.60233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.5 
 
 
1297 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1722  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.03 
 
 
1369 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.166635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.57 
 
 
1297 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.62 
 
 
1297 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2701  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.14 
 
 
275 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0976  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.93 
 
 
269 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.865237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1405  phosphoribosylformylglycinamidine synthetase I  30.74 
 
 
270 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0273438  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.66 
 
 
1292 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0002  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.66 
 
 
1297 aa  106  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.92 
 
 
1298 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.35 
 
 
1293 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.05 
 
 
1313 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03300  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  29.43 
 
 
1355 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0770  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.78 
 
 
1334 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.59 
 
 
1299 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.12 
 
 
1293 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0682  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.4 
 
 
1334 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1153  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.13 
 
 
1291 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609825  hitchhiker  0.0000127323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.94 
 
 
1295 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  28.73 
 
 
274 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08121  phosphoribosylformylglycinamidine synthase (Eurofung)  32.03 
 
 
1360 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0219218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.76 
 
 
1294 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164924  normal  0.914439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.08 
 
 
1295 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.23 
 
 
1293 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.77 
 
 
1293 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0157  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.64 
 
 
269 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.89 
 
 
1298 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1764  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  31.17 
 
 
269 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1870  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.65 
 
 
1348 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.395748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.06 
 
 
1298 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1858  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.15 
 
 
1368 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.84 
 
 
1293 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.84 
 
 
1293 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.84 
 
 
1293 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.54 
 
 
1368 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0128608  normal  0.262912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.84 
 
 
1293 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.06 
 
 
1298 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39660  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  30.92 
 
 
1298 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>