More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1628 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1628  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  100 
 
 
269 aa  556  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1062  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  73.28 
 
 
282 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472899  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0473  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  74.05 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.757079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1182  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.87 
 
 
269 aa  264  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1178  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.37 
 
 
272 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0773  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.94 
 
 
269 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1497  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.37 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0652  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  44.24 
 
 
264 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0644813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0483  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.66 
 
 
276 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0433  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  41.89 
 
 
269 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0362  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.7 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1018  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  39.26 
 
 
265 aa  209  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.373164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1405  phosphoribosylformylglycinamidine synthetase I  42.75 
 
 
270 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0273438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0621  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  42.86 
 
 
256 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1512  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  44.59 
 
 
269 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0681129  decreased coverage  0.000672493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  41.22 
 
 
254 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.07 
 
 
255 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000211584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  40.67 
 
 
266 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_002936  DET0378  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.07 
 
 
255 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0976  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.91 
 
 
269 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.865237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2067  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.77 
 
 
274 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0434  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.37 
 
 
269 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0601062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2371  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.59 
 
 
258 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0157  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.24 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1327  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  37.41 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.68 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1169  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  41.28 
 
 
257 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0911  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  39 
 
 
253 aa  169  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0450611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  36.63 
 
 
275 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.888308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1764  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  40.96 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  36.04 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  37.32 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0448  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.25 
 
 
240 aa  162  7e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  35.69 
 
 
275 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2701  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.16 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1890  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.63 
 
 
274 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3769  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.31 
 
 
256 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1845  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.15 
 
 
268 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3854  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.19 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1608  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.25 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.185511  normal  0.319722 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0517  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  33.47 
 
 
248 aa  139  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.37 
 
 
1341 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.61 
 
 
1292 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2771  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.89 
 
 
1295 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.51 
 
 
1297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.17 
 
 
1293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.25 
 
 
1298 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.94 
 
 
1342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0359438  normal  0.315795 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.17 
 
 
1345 aa  128  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  42.86 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.4 
 
 
1354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.55 
 
 
1345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.25 
 
 
1296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.52 
 
 
230 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294122  normal  0.0182898 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17772  predicted protein  33.87 
 
 
1313 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.02 
 
 
1301 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1223  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.25 
 
 
1295 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.83 
 
 
1345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.62 
 
 
1293 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.17 
 
 
1368 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0128608  normal  0.262912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.25 
 
 
1295 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.83 
 
 
1309 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.42 
 
 
1354 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0378241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1082  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.56 
 
 
1295 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.60233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 
1293 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.03 
 
 
1295 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.03 
 
 
1295 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0268  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.03 
 
 
1295 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0293  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3052  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.84 
 
 
1295 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 
1293 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 
1293 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4981  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.58 
 
 
1357 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.875637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.78 
 
 
1295 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.89 
 
 
1293 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.06 
 
 
1297 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.86 
 
 
1311 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.77 
 
 
1252 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.78 
 
 
1414 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.077761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1749  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  44.81 
 
 
233 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  35.83 
 
 
1348 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.47 
 
 
1293 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.63 
 
 
1295 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3675  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.75 
 
 
1323 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1446  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.1 
 
 
1353 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.63 
 
 
1295 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.33 
 
 
1293 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.89 
 
 
1293 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.13 
 
 
1354 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1914  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.13 
 
 
1354 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2342  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.1 
 
 
1359 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.33 
 
 
1293 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.75 
 
 
1297 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>