More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1405 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1405  phosphoribosylformylglycinamidine synthetase I  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0273438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.28 
 
 
266 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.23 
 
 
254 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1845  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.06 
 
 
268 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1182  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  40 
 
 
269 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0773  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.58 
 
 
269 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1628  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  42.75 
 
 
269 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1178  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.53 
 
 
272 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1497  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.58 
 
 
269 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0621  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  44.44 
 
 
256 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2371  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  39.68 
 
 
258 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3769  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.73 
 
 
256 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1169  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  42.15 
 
 
257 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.15 
 
 
255 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0473  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.4 
 
 
277 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.757079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1062  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  39.76 
 
 
282 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472899  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  41.6 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000211584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3854  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.85 
 
 
289 aa  181  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0378  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  41.49 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0911  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  39.76 
 
 
253 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0450611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0433  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  42.44 
 
 
269 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0517  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.66 
 
 
248 aa  170  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2067  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.93 
 
 
274 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1890  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.49 
 
 
274 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  40.08 
 
 
274 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0483  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.7 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1327  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  39.92 
 
 
275 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  38.46 
 
 
275 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1018  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  38.59 
 
 
265 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.373164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  35.36 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.888308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  35.71 
 
 
275 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2701  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.96 
 
 
275 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0157  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.55 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0434  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.02 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0601062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  38.33 
 
 
230 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294122  normal  0.0182898 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0652  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I, putative  36.11 
 
 
264 aa  145  9e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0644813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0976  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.02 
 
 
269 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.865237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1512  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.48 
 
 
269 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0681129  decreased coverage  0.000672493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1608  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.43 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.185511  normal  0.319722 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0362  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.04 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1764  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.15 
 
 
269 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  39.13 
 
 
234 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3613  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.1 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.88 
 
 
226 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1421  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.5 
 
 
217 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3506  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.32 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4091  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.25 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0407  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.37 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5057  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.16 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1055  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.5 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02510  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  36.03 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1014  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.64 
 
 
233 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1523  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.52 
 
 
235 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23390  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  36.25 
 
 
241 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4766  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.44 
 
 
223 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2250  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.99 
 
 
227 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4981  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.02 
 
 
227 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.02 
 
 
227 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.89 
 
 
233 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0863769 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1473  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.68 
 
 
234 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.93 
 
 
1252 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0541  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.63 
 
 
261 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1979  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.17 
 
 
222 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0268  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.02 
 
 
226 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2755  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.89 
 
 
232 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000714476  hitchhiker  0.00646528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0293  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3126  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.3 
 
 
237 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2075  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.22 
 
 
225 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.476398  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0272  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.44 
 
 
227 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.6 
 
 
227 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0847  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.95 
 
 
227 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.25 
 
 
235 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000119271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.18 
 
 
233 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4552  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.27 
 
 
224 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.86 
 
 
226 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.618821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4640  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.27 
 
 
224 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.4 
 
 
1236 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4935  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.8 
 
 
224 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0314  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35 
 
 
230 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.1 
 
 
222 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10804  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.39 
 
 
224 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.893292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5406  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.66 
 
 
233 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1134  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.48 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0679  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  37.04 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1749  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.66 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2954  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.98 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.392911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.89 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0258  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  36.05 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.17 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1655  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.35 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.549373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4069  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  35.95 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.31239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.29 
 
 
226 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  34.58 
 
 
238 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.492286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>