53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3191 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3191  malonate decarboxylase subunit delta  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.416357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6856  malonate decarboxylase subunit delta  65.35 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1242  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549114  normal  0.0355903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4413  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2802  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1270  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00245775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0789  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.058655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1160  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965785  normal  0.221003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1148  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2049  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 104 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3036  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0540  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1483  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1453  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0682344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0613  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.763622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1257  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.529343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1583  malonate decarboxylase subunit delta  70.3 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3152  malonate decarboxylase subunit delta  63.37 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0047  malonate decarboxylase subunit delta  62.38 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328223  normal  0.098952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0025  malonate decarboxylase subunit delta  62.38 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0026  malonate decarboxylase subunit delta  62.38 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0168  malonate decarboxylase subunit delta  59.41 
 
 		 102 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381062  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4287  malonate decarboxylase subunit delta  60 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1767  malonate decarboxylase acyl carrier protein  47.52 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0891324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1844  malonate decarboxylase delta subunit  51.55 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.457888  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1145  putative malonate decarboxylase delta subunit  41.58 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.719808  normal  0.745191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2894  delta subunit of malonate decarboxylase  49 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.222092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1080  malonate decarboxylase subunit delta  45 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5373  malonate decarboxylase acyl carrier protein  45.54 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00827947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0078  malonate decarboxylase acyl carrier protein  41.58 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.343361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4591  malonate decarboxylase subunit delta  43.43 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0793  delta subunit of malonate decarboxylase  38 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0483637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4819  malonate decarboxylase subunit delta  40.38 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030528  normal  0.0215828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5085  malonate decarboxylase subunit delta  38.24 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.241533  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1846  malonate decarboxylase subunit delta  39.42 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.431164  normal  0.0404894 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  43.9 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2895  malonate decarboxylase delta subunit  47.42 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.0309088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5085  malonate decarboxylase, delta subunit  40 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0444  malonate decarboxylase subunit delta  39 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4019  malonate decarboxylase delta subunit  41.9 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5300  malonate decarboxylase subunit delta  39.22 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185223  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0948  malonate decarboxylase subunit delta  35.29 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.798455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10300  malonate decarboxylase subunit delta  36.89 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00121331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1323  malonate decarboxylase delta subunit  32.99 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2881  malonate decarboxylase subunit delta  34 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2440  malonate decarboxylase subunit delta  34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0411324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3297  malonate decarboxylase delta subunit  31.96 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3865  malonate decarboxylase acyl carrier protein  34.86 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4941  malonate decarboxylase acyl carrier protein  34.86 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0738205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1058  malonate decarboxylase delta subunit  28.87 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.453426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02570  malonate decarboxylase subunit delta  37.76 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00238435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0294  malonate decarboxylase subunit delta  35.05 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329066  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4927  malonate decarboxylase subunit delta  35.64 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>