18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1937 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1937  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  179  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1651  protein of unknown function DUF211  70 
 
 
95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0810924  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1414  protein of unknown function DUF211  52.33 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0275  hypothetical protein  46.51 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1311  hypothetical protein  46.51 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1414  hypothetical protein  44.19 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.433885  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1426  hypothetical protein  43.02 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306727  normal  0.717871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0482  hypothetical protein  43.02 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0500067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1191  hypothetical protein  47.67 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.854674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1208  hypothetical protein  41.86 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0055  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1129  hypothetical protein  47.13 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000200826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0081  hypothetical protein  47.13 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.861033  normal  0.214557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0138  protein of unknown function DUF211  40.23 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0221  hypothetical protein  43.68 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0090  hypothetical protein  47.19 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4270  protein of unknown function DUF211  37.93 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0694507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2293  hypothetical protein  34.44 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>