13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2293 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2293  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1414  hypothetical protein  43.21 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.433885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4270  protein of unknown function DUF211  37.66 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0694507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0138  protein of unknown function DUF211  38.75 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1426  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306727  normal  0.717871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1208  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0482  hypothetical protein  40.74 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0500067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1191  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.854674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1311  hypothetical protein  41.56 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1414  protein of unknown function DUF211  34.67 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1651  protein of unknown function DUF211  32.18 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0810924  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1937  hypothetical protein  34.44 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>