30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4189 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4189  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18195  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0931  hypothetical protein  59.09 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2299  hypothetical protein  48.08 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1189  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253774  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6286  hypothetical protein  56.1 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0534  hypothetical protein  53.66 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0393  hypothetical protein  52.38 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1421  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3690  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.412494 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3491  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198808  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1073  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612247  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5661  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.877181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3679  hypothetical protein  54.29 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2442  hypothetical protein  51.11 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000201124  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0150  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.1945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3304  hypothetical protein  51.43 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0901593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5483  hypothetical protein  51.43 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4788  hypothetical protein  51.43 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5378  hypothetical protein  51.43 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0170  hypothetical protein  48.57 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987392  normal  0.197405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5368  hypothetical protein  48.57 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4822  hypothetical protein  48.57 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0674  hypothetical protein  56.67 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2844  hypothetical protein  48.89 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0175751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2465  hypothetical protein  48.89 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.400017  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2104  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1838  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0999762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0840  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1130  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352482  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1766  hypothetical protein  55.56 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>