45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0931 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0931  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2299  hypothetical protein  76.19 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1189  hypothetical protein  57.81 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1073  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612247  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3690  hypothetical protein  53.12 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5661  hypothetical protein  53.12 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.877181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0393  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0534  hypothetical protein  54.55 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2442  hypothetical protein  50.91 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000201124  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3491  hypothetical protein  49.15 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1421  hypothetical protein  49.15 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0150  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.1945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2844  hypothetical protein  50.91 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0175751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2465  hypothetical protein  50.91 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.400017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6286  hypothetical protein  51.92 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3304  hypothetical protein  48.28 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0901593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0170  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987392  normal  0.197405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4822  hypothetical protein  54.35 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5368  hypothetical protein  54.35 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5378  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4788  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5483  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4189  hypothetical protein  59.09 
 
 		 53 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3679  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1130  hypothetical protein  54.76 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0331  hypothetical protein  51.11 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2104  hypothetical protein  54.76 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0425  hypothetical protein  51.11 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681164  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0840  hypothetical protein  54.76 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2151  hypothetical protein  51.11 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1838  hypothetical protein  54.76 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0999762  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1766  hypothetical protein  54.76 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0111  hypothetical protein  47.92 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0095  hypothetical protein  47.92 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0674  hypothetical protein  46.67 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  40.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  37.14 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2121  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.17765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  34.38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.712573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2107  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>