43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0393 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0393  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1189  hypothetical protein  85.71 
 
 
68 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253774  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3690  hypothetical protein  79.37 
 
 
65 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.412494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2844  hypothetical protein  82.26 
 
 
62 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0175751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0534  hypothetical protein  80.95 
 
 
63 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2465  hypothetical protein  82.26 
 
 
62 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.400017  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6286  hypothetical protein  75 
 
 
65 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528352  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2442  hypothetical protein  79.03 
 
 
62 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000201124  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0150  hypothetical protein  77.78 
 
 
64 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.1945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5661  hypothetical protein  77.42 
 
 
64 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.877181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1073  hypothetical protein  75.81 
 
 
64 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612247  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3491  hypothetical protein  76.19 
 
 
65 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198808  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1421  hypothetical protein  74.6 
 
 
65 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3304  hypothetical protein  82.54 
 
 
64 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0901593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0170  hypothetical protein  80.95 
 
 
64 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987392  normal  0.197405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5368  hypothetical protein  80.95 
 
 
64 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4822  hypothetical protein  80.95 
 
 
64 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3679  hypothetical protein  77.78 
 
 
64 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4788  hypothetical protein  78.12 
 
 
64 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5483  hypothetical protein  78.12 
 
 
64 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5378  hypothetical protein  78.12 
 
 
64 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2104  hypothetical protein  84.13 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1838  hypothetical protein  84.13 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0999762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0840  hypothetical protein  84.13 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1766  hypothetical protein  82.81 
 
 
78 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1130  hypothetical protein  82.81 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352482  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0425  hypothetical protein  84.13 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0331  hypothetical protein  84.13 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2151  hypothetical protein  84.13 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0674  hypothetical protein  72.58 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0095  hypothetical protein  76.19 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0111  hypothetical protein  77.59 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0931  hypothetical protein  54.84 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2299  hypothetical protein  53.45 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4189  hypothetical protein  52.38 
 
 
53 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18195  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  36.07 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  34.43 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  34.43 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  36.07 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.712573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  34.43 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  36.07 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2121  hypothetical protein  34.43 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  34.43 
 
 
83 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>