42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1421 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3491  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3690  hypothetical protein  89.23 
 
 		 65 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412494 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6286  hypothetical protein  81.54 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1073  hypothetical protein  81.25 
 
 		 64 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612247  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5661  hypothetical protein  79.69 
 
 		 64 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.877181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2442  hypothetical protein  83.05 
 
 		 62 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000201124  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4788  hypothetical protein  84.13 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0393  hypothetical protein  74.6 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5483  hypothetical protein  84.13 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5378  hypothetical protein  84.13 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3304  hypothetical protein  82.81 
 
 		 64 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0901593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3679  hypothetical protein  88.14 
 
 		 64 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0170  hypothetical protein  81.25 
 
 		 64 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987392  normal  0.197405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4822  hypothetical protein  81.25 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1189  hypothetical protein  69.23 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5368  hypothetical protein  81.25 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2844  hypothetical protein  79.66 
 
 		 62 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0175751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2465  hypothetical protein  79.66 
 
 		 62 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.400017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0534  hypothetical protein  74.58 
 
 		 63 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0840  hypothetical protein  89.83 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1838  hypothetical protein  89.83 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0999762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2104  hypothetical protein  89.83 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1766  hypothetical protein  89.83 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1130  hypothetical protein  89.83 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0150  hypothetical protein  67.19 
 
 		 64 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.1945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2151  hypothetical protein  89.83 
 
 		 64 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0331  hypothetical protein  89.83 
 
 		 64 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0425  hypothetical protein  89.83 
 
 		 64 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0674  hypothetical protein  83.05 
 
 		 62 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0111  hypothetical protein  70.83 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0095  hypothetical protein  70.83 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0931  hypothetical protein  49.15 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2299  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4189  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2121  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2446  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.17765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  36.21 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>