39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2844 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0175751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.400017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0393  hypothetical protein  82.26 
 
 		 64 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0150  hypothetical protein  80.33 
 
 		 64 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.1945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2442  hypothetical protein  80.65 
 
 		 62 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000201124  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5661  hypothetical protein  81.97 
 
 		 64 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.877181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1189  hypothetical protein  75.81 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1073  hypothetical protein  79.03 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612247  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3690  hypothetical protein  83.05 
 
 		 65 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0534  hypothetical protein  77.05 
 
 		 63 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6286  hypothetical protein  77.05 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3491  hypothetical protein  81.36 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1421  hypothetical protein  79.66 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1838  hypothetical protein  83.87 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0999762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2104  hypothetical protein  83.87 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1130  hypothetical protein  83.87 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352482  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0840  hypothetical protein  83.87 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1766  hypothetical protein  83.87 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3679  hypothetical protein  77.42 
 
 		 64 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5368  hypothetical protein  80.33 
 
 		 64 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4822  hypothetical protein  80.33 
 
 		 64 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0425  hypothetical protein  83.87 
 
 		 64 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0331  hypothetical protein  83.87 
 
 		 64 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2151  hypothetical protein  83.87 
 
 		 64 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3304  hypothetical protein  81.67 
 
 		 64 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0901593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0170  hypothetical protein  80 
 
 		 64 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987392  normal  0.197405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4788  hypothetical protein  76.67 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5483  hypothetical protein  76.67 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5378  hypothetical protein  76.67 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0674  hypothetical protein  77.55 
 
 		 62 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0111  hypothetical protein  70.97 
 
 		 64 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0095  hypothetical protein  70.97 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2299  hypothetical protein  55.17 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0931  hypothetical protein  50.91 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.712573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4189  hypothetical protein  48.89 
 
 		 53 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0147  hypothetical protein  47.73 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  38.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>