27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3829 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3829  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3583  hypothetical protein  82.68 
 
 
131 aa  220  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3870  hypothetical protein  81.1 
 
 
131 aa  218  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4888  hypothetical protein  74.8 
 
 
128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2420  hypothetical protein  81.61 
 
 
93 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.959786 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6270  hypothetical protein  50.42 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5167  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  103  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.67808  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6386  hypothetical protein  34.23 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.897435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2424  hypothetical protein  33.91 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137325  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7010  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4723  hypothetical protein  44.29 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3255  hypothetical protein  37.66 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2888  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4981  hypothetical protein  32.53 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1011  hypothetical protein  38.37 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7825  hypothetical protein  34.88 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0112  hypothetical protein  63.04 
 
 
49 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8755  hypothetical protein  35.82 
 
 
149 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0840153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6426  hypothetical protein  25.2 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2281  hypothetical protein  31.17 
 
 
84 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2439  hypothetical protein  28.42 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3996  hypothetical protein  34.29 
 
 
207 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2303  hypothetical protein  30.26 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4881  hypothetical protein  38.55 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.597968  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3206  hypothetical protein  44.74 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5002  hypothetical protein  32.26 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>