29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3870 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3870  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3583  hypothetical protein  97.71 
 
 
131 aa  263  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3829  hypothetical protein  81.1 
 
 
131 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4888  hypothetical protein  78.12 
 
 
128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2420  hypothetical protein  80.22 
 
 
93 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.959786 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6270  hypothetical protein  51.28 
 
 
120 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5167  hypothetical protein  72.5 
 
 
84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.67808  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6386  hypothetical protein  37.27 
 
 
116 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.897435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2424  hypothetical protein  35.34 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4723  hypothetical protein  36.45 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7010  hypothetical protein  46.58 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3255  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0112  hypothetical protein  76.09 
 
 
49 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2888  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6426  hypothetical protein  28.91 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4981  hypothetical protein  33.73 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7825  hypothetical protein  37.21 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1011  hypothetical protein  40.23 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4881  hypothetical protein  50.82 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.597968  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8755  hypothetical protein  35.82 
 
 
149 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0840153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2281  hypothetical protein  32.86 
 
 
84 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5002  hypothetical protein  34.85 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2046  hypothetical protein  39.22 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3206  hypothetical protein  34.69 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5710  hypothetical protein  34.55 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2439  hypothetical protein  25.81 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3996  hypothetical protein  28.16 
 
 
207 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>