29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5002 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5002  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2281  hypothetical protein  87.67 
 
 
84 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2424  hypothetical protein  83.1 
 
 
126 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3255  hypothetical protein  90.48 
 
 
135 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2046  hypothetical protein  90.32 
 
 
64 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7825  hypothetical protein  76.71 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4981  hypothetical protein  71.23 
 
 
90 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6426  hypothetical protein  80.95 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5710  hypothetical protein  78.79 
 
 
84 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7051  hypothetical protein  81.97 
 
 
89 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6386  hypothetical protein  83.05 
 
 
116 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.897435  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8134  hypothetical protein  79.03 
 
 
64 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22372  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7010  hypothetical protein  71.01 
 
 
104 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8755  hypothetical protein  65.71 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0840153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4723  hypothetical protein  67.19 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2888  hypothetical protein  70 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  63.77 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3211  hypothetical protein  75.41 
 
 
64 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1011  hypothetical protein  57.75 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3777  hypothetical protein  62.22 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2303  hypothetical protein  80 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3870  hypothetical protein  34.85 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3091  hypothetical protein  67.57 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3583  hypothetical protein  34.85 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3206  hypothetical protein  86.36 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4888  hypothetical protein  30.14 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3829  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3996  hypothetical protein  32.5 
 
 
207 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2439  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>