32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3255 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3255  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2424  hypothetical protein  88.76 
 
 
126 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6386  hypothetical protein  85.71 
 
 
116 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.897435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6426  hypothetical protein  75.27 
 
 
144 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7010  hypothetical protein  68.13 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7825  hypothetical protein  75.61 
 
 
92 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2888  hypothetical protein  63.04 
 
 
106 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  63.33 
 
 
205 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4723  hypothetical protein  63.04 
 
 
127 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2281  hypothetical protein  90.62 
 
 
84 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5002  hypothetical protein  90.48 
 
 
73 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4981  hypothetical protein  70.13 
 
 
90 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8755  hypothetical protein  65.82 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0840153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2046  hypothetical protein  94.23 
 
 
64 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1011  hypothetical protein  58.82 
 
 
92 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7051  hypothetical protein  83.05 
 
 
89 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5710  hypothetical protein  69.01 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3206  hypothetical protein  83.67 
 
 
61 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8134  hypothetical protein  75.86 
 
 
64 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2303  hypothetical protein  76.36 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3211  hypothetical protein  70.18 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3870  hypothetical protein  40.74 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3583  hypothetical protein  40.74 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4888  hypothetical protein  39.74 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3829  hypothetical protein  37.66 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3777  hypothetical protein  64.29 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2439  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6270  hypothetical protein  28.71 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2420  hypothetical protein  36.92 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.959786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3996  hypothetical protein  34.78 
 
 
207 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5167  hypothetical protein  36.92 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.67808  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2967  hypothetical protein  82.61 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>