17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2420 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2420  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  192  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.959786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3870  hypothetical protein  80.22 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3583  hypothetical protein  80.22 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3829  hypothetical protein  81.61 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4888  hypothetical protein  72.73 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6270  hypothetical protein  52.81 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5167  hypothetical protein  70.73 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.67808  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6386  hypothetical protein  38.67 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.897435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4723  hypothetical protein  34.52 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2888  hypothetical protein  48.94 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7010  hypothetical protein  51.06 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3255  hypothetical protein  36.92 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  46.51 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2303  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2439  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7825  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>