14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0031 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0031  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.646268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0022  tRNA-Cys  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.643955  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0035  tRNA-Cys  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.37225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0042  tRNA-Cys  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.771435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0037  tRNA-Cys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0044  tRNA-Cys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0040  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0030  tRNA-Cys  97.22 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.606111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0043  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0059  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0136384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0039  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0040  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.955881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0004  tRNA-Cys  88.1 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>