10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0040 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0044  tRNA-Cys  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0022  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.643955  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0031  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.646268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0035  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.37225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0042  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.771435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0037  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0014  tRNA-OTHER  93.02 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.292815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0031  tRNA-OTHER  93.02 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0059  tRNA-OTHER  93.02 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000158914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>