11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0042 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.643955  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0035  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.37225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0042  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.771435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0031  tRNA-Cys  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.646268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0037  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0044  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0040  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0030  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.606111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0014  tRNA-OTHER  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.292815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0031  tRNA-OTHER  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0059  tRNA-OTHER  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000158914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>