10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0004 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0004  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0039  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0040  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.955881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0030  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 71 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.606111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0650  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0683  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000909207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0044  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0054  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0001  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.536129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0031  tRNA-Cys  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.646268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>