10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0059 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0043  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0059  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0136384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0019  tRNA-Cys  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.917742  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0020  tRNA-Cys  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.694675  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0053  tRNA-Cys  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.114886  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0024  tRNA-OTHER  96.77 
 
 
88 bp  54  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0047  tRNA-OTHER  96.77 
 
 
91 bp  54  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0044  tRNA-Cys  83.33 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0031  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.646268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>